По време на периоди на спиране и съхранение, сушилните машини трябва да се поставят на сухо, добре проветриво място, за да се предотврати продължително излагане на влажна, висока температура или среда на открито. Това е особено критично за оборудването за сушене на зърно, което обикновено съдържа вътрешни компоненти като вентилатори, двигатели, транспортни механизми и електрически системи за управление; лошите условия на съхранение могат лесно да доведат до проблеми като влошаване на качеството на окабеляването, корозия на метала и увреждане на части от влага. Преди да бъде преместено в склад, оборудването трябва да бъде подложено на цялостно вътрешно почистване, за да се отстранят всички остатъчни зърна, прах или отломки, като по този начин се предотврати растежа на мухъл или нашествия от вредители, причинени от продължително натрупване. Едновременно с това, сушилните контейнери, каналите за горещ въздух и транспортните компоненти трябва да бъдат подробно проверени; всички износени или разхлабени части трябва да бъдат ремонтирани или затегнати незабавно, за да се предотвратят неизправности по време на бъдеща работа.
По време на периода на съхранение трябва да се прилагат и подходящи защитни мерки за критичните компоненти. Откритите метални повърхности на оборудването трябва да бъдат покрити с масло против ръжда, докато лагерите, веригите и трансмисионните механизми изискват редовно смазване и поддръжка, за да се предотврати задръстване или ръждясване, причинено от продължително бездействие. Електрическите компоненти - като двигатели, контролни шкафове и сензори - в идеалния случай трябва да бъдат покрити с влагоустойчиви материали или запечатани отделно, за да се предотврати проникването на влага от компрометиране на работата на оборудването. Ако оборудването трябва да остане неактивно за продължителен период от време, колесните или мобилните сушилни машини трябва да бъдат правилно поддържани, за да се облекчи налягането върху гумите и да се предотврати деформация, причинена от продължително носене на натоварване. Освен това съоръжението за съхранение трябва да поддържа строги стандарти за пожарна безопасност; натрупването на запалими или експлозивни материали около оборудването е строго забранено, за да се гарантира безопасността при съхранение. Придържането към стандартизирани практики за управление на съхранението не само удължава експлоатационния живот на сушилните машини, но също така намалява бъдещите разходи за поддръжка, като същевременно повишава цялостната стабилност и безопасност на операциите на оборудването.
